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RefSeqとは

RefSeq
Reference Sequence(RefSeq)は、主要な生物のゲノムDNA,転写物RNA,蛋白質を含む配列データを完全で、統合された、重複のないセットとしてNCBIから提供されている配列データ。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/RefSeq/
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UCSC GenomeBrowser for Functional RNA 機能性RNAのUCSC GenomeBrowser表示DB

UCSC GenomeBrowser for Functional RNA
http://www.ncrna.org/glocal/cgi-bin/hgGateway
経済産業省「機能性RNAプロジェクト」で得られた成果の中で、UCSC GenomeBrowser上に機能性RNAを表示するデータベース

RNAやDNAの構造

mfold
mfoldはRNAやDNAの二次構造を予測するプログラムです。

Michael Zuker's Home Page
RNA & DNA Folding Applications

SimTK RNA Folding
SimTK RNA Folding
SimTKのプロジェクトの中の、ToRNADoはPDBコードやファイルからRNA二次構造を表示・作画できるフリーソフトです。

National NIH Center for Physics-based Simulation of Biological Structures

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